LEGO MarvelSuper Heroes cuenta con un guión original en el que participan todas las familias de personajes de Marvel. Los jugadores podrán tomar el control de Iron Man, Spider-Man, Hulk, Capitán América, Lobezno y muchos personajes más de Marvel para intentar detener a Loki y al resto de villanos de Marvel en su intento por conseguir el arma definitiva capaz de someter al planeta Tierra. Los jugadores deberán conseguir piezas de LEGO mientras exploran unaciudad de Nueva York hecha de esas piezas. Además, podránvisitarotras localizaciones del Universo Marvel como la Torre Stark, el Asteroide M, la base Hydra abandonada o la Mansión-X
